La mer Rouge est un environnement riche et un foyer nourricier pour de nombreuses espèces animales et végétales. Marsa Alam abrite plus de 1000 espèces de poissons et plus de 200 espèces de coraux durs divers qui sont spécialement adaptés aux changements de température de la mer tout au long de l'année dans la région. Les tortues de mer et les dauphins sont un spectacle courant sur Marsa Alam et les touristes peuvent même voir l'extraordinaire vache de mer (dugong) le matin à Marsa Mubarak, Marsa Shouna et Marsa Egla, près de Port Ghalib.

Près du Malikia Resort, les touristes peuvent trouver des réserves naturelles qui encouragent le respect et la protection des animaux, des plantes et de leurs habitats naturels. Dans la région de Marsa Alam, les touristes peuvent visiter le récif de Samadi et découvrir ses 5000 dauphins qui aiment nager la nuit. Dans le récif de Daedelus, les plongeurs peuvent trouver de grands poissons, des anguilles, des thons et même des requins-marteaux. La réserve de Hamata est une zone de préservation naturelle qui comprend des récifs coralliens et d'autres espèces marines exotiques, comme des espèces rares d'herbes marines. Pour les amoureux de la terre, la région de Marsa Alam possède également la réserve naturelle de Jebel Elba, qui contient des vallées remplies d'animaux sauvages, d'oiseaux de mer et de plantes.